В военные годы сотрудники Лаборатории были эвакуированы в Красноярск и все заботы о ее сохранении, устройстве быта ученых и их семей лежали на плечах В.Г. Богорова. В этот период под его руководством проведены исследования Полярного бассейна и определены районы промысла рыбы. Самоотверженная и плодотворная работа в Сибири стала основой для расширения Лаборатории. С 1943 по 1948 годы в ее состав влились крупные ученые: В.Б. Штокман, А.Д. Добровольский, Г.А. Ушаков, Л.А.Зенкевич, П.Л. Безруков, Т.С. Расс.
Богоров и Кудинов готовят к работе планктоно-собиратель Богорова. НИС "Витязь", 2-ой рейс. 1949 г.
Постановление Президиума АН СССР от 24 декабря 1946 года, утвердившее организацию Института океанологии, совпало с днем рождения В.Г.Богорова и с воплощением давно возникших планов.
Вениамин Григорьевич часто выступал в качестве лектора по пропаганде географических знаний. Талант ученого проявился и в написании научно-популярных книг и статей о Мировом океане. Уже в 1945 г. выходит его первая научно-популярная книга «Подводный мир», затем «Моря и океаны» (1948), «Жизнь моря» (1950), «Океан» (1955) и другие.
В.Г. Богоров на сессии ЮНЕСКО. 1963 г.
Роль В.Г. Богорова в исследовании биологической структуры Мирового океана уникальна. Именно он занимался общими проблемами морской планктонологии и биологии моря, вопросами биогеографического районирования пелагиали по планктону, выделил связь между климатической зональностью нашей планеты и закономерностями распределения планктона. Особое внимание уделял проблеме биологической продуктивности Мирового океана и рациональному использованию его биологических ресурсов человеком.